Bioinformatički alati i podaci

• MethSpec: jednostavan i efikasan alat za procenu specifičnosti prajmera za MSP
  MethSpec je jednostavan alat koji vrši procenu specifičnosti prajmera dizajniranih za analizu metilacionog statusa promotora gena, upotrebom metode metilacija-specifični PCR (MSP).
  
  
• TRI_tool - Interakcije kod transkripcionih regulacija
  Alat za predviđanje interakcije TRI_tool je otvoren web servis za pronalaženje interaktora transkripcione regulacije.
  
  
• IDPpi_tool - Interakcije kod suštinski neuređenih proteina kod čoveka
  Alat IDPpi_tool je otvoren web servis za pronalaženje proteina, interaktora suštinski neuređenih proteina kod čoveka.
  
  
• HP-GAS - Predviđanje interakcija protein protein kod čoveka
  HP-GAS je program za predviđanje proteinskih interakcija kod čoveka, koji koristi grafovske, evolutivne i sekvencne osobine proteina. Zasnovan je na ansamblu modela generisanih algoritmima mašinskog učenja, gde je automatsko asembliranje vođeno genetskim algoritmom.
  
  
• DiNGO - Analiza termina genskih ontologija (GO) i fenotipskih ontologija čoveka (HPO)
  DiNGO je program zasnovan na otvorenom kodu softvera BiNGO, koji je napisan u JAVA jeziku, a ima cilj da odredi koje kategorije genskih ontologija su prenaglašene u određenom skupu gena.
  
  
• EpiMut - Funkcionalna anotacija aminokiselinskih substitucija kod epigenetskih faktora
  EpiMut je program za anotaciju mutacija epigenetskih faktora, koji je zasnovan na biohemijskim i fizikohemijskim karakteristikama aminokiselina i metodi digitalne obrade signala kod proteinskih sekvenci, a nezavisan je od poravnanja sekvenci i homoloških pretraživanja.